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将发现的甜瓜的所有遗传基因信息纳入数据库 ~有助于开发和生产优质甜瓜~

2017/12/08

筑波大学生命环境系 矢野 亮一助教、江面 浩教授(筑波植物创新研究中心主任)等报告称,已明确我国优质甜瓜品种“甜瓜春系3号”的全基因组表达基因信息(转录组)并将其数据库化。

不仅为了基础科学研究的推进,更为了基于遗传功能理解的品种设计的推进,将网络数据库作为信息聚合/传播的中心是必不可少的。此项研究,在温室栽培环境中收集了覆盖所有组织的约27,000个甜瓜基因组基因的表达信息概况。并且将这项研究成果信息数据库化,开发了可以从数据库进行基因功能分析的应用工具 个人网站“Melonet-DB”。今后,我们期待“Meonet-DB”可以成为来自世界各地的研究人员搜索有关甜瓜基因组信息的中心信息数据库。


図 将甜瓜表达基因信息(转录组信息)以组织分类后的聚集结果

刊载论文

【题 目】 Melonet-DB, A Grand RNA-seq Gene Expression Atlas in Melon (Cucumis melo L.) (甜瓜的表达遗传基因信息数据库“Melonet-DB”的开发)
【作者名】 Ryoichi Yano, Satoko Nonaka, Hiroshi Ezura
【刊载杂志】 Plant and Cell Physiology
Doi: 10.1093/pcp/pcx193

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