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머스크 멜론의 전체 유전자 발현 정보를 데이터 베이스화 ―고품질 멜론 개발 생산에 공헌―

2017/12/08

 쓰쿠바 대학 생명환경계 야노 료이치(矢野 亮一) 조교, 에즈라 히로시(江面 浩) 교수(쓰쿠바 기능 식물 이노베이션 연구 센터장)는 일본의 고급 머스크멜론 품종 「알스페보리트 춘계 3호」에 대해서 전체 게놈 발현 유전자 정보(전사체)를 밝혀내고 데이터 베이스화했습니다.

 기초적인 과학 연구의 추진뿐만 아니라 유전자 기능의 이해에 기초한 품종 디자인을 발전시키기 위해 정보 집약・제공을 중점으로 하는 web데이터 베이스가 필수불가결합니다. 본 연구에서는 멜론 게놈이 가진 약 27,000가지의 유전자의 발현 정보 프로필을 온실 재배 환경에서 모든 조직을 망라하는 형태로 수집했습니다. 이러한 연구 성과를 정보 데이터 베이스화로 해당 데이터 베이스에서 유전자 기능 분석을 실시가 가능한 애플리케이션을 독자적인 web사이트 「Melonet-DB」로 개발했습니다. 이후 Meonet-DB는 세계 각지의 연구자가 멜론 게놈에 관한 정보 검색을 하고 그 중추적인 데이터 베이스로써 역할을 하는 것이 기대되고 있습니다.


그림 멜론 조직별 발현 유전자 정보(전사체 정보)의 클러스터 분석 결과

게재논문

【제목】 Melonet-DB, A Grand RNA-seq Gene Expression Atlas in Melon (Cucumis melo L.) (멜론의 발현
 유전자 정보 데이터 베이스「Melonet-DB」의 개발)
【저자명】 Ryoichi Yano, Satoko Nonaka, Hiroshi Ezura
【게재지】 Plant and Cell Physiology
 Doi: 10.1093/pcp/pcx193

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