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말똥 성게(Hemicentrotus pulcherrimus)의 게놈을 해독 〜연구・교육추진을 위한 게놈 데이터베이스를 공개〜

2018/03/13

쓰쿠바대학 생명환경계 야구치 슌스케(谷口 俊介)준교수(시모다임해실험센터)는, 정보・시스템연구기구 국립유전자 연구소 유전정보 분석 연구실의 이케오 카즈호(池尾 一穂)준교수, 킨조 소노코(金城 その子)연구원, 오차노미즈 여자대학 연안생물교육연구센터의 키요모토 마사토(清本 正人)준교수, 히로시마대학 대학원 이학연구과 야마모토 타카시(山本 卓)교수와의 공동연구에 의해, 말똥성게(바훈우니; Hemicentrotus pulcherrimus)의 게놈 배열을 해독했습니다.

말똥성게는 홋카이도 남단의 남쪽 지역의 해안선에서 자주 출현하는 성게의 일종이며, 지역에 따라 귀중한 어획 대상이기도 합니다. 또한, 채집이 쉽고, 알이나 정자 등 배우자 획득의 간편함으로 인해, 발생생물학, 세포생물학 등에서 훌륭한 연구재료로 사용되는 것뿐만 아니라, 동물의 발생을 배우는 교육현장에 있어서도 일본에서는 오랫동안 사용돼 왔습니다. 본 연구에서는 말똥성게의 게놈 배열을 해독하고, 연구・교육과정으로 이용할 수 있는 데이터베이스 「HpBase」(http://cell-innovation.nig.ac.jp/Hpul/)를 작성했습니다.


그림. HpBase의 홈페이지

게재논문

【제 목】 HpBase: a genome data base of a sea urchin, Hemicentrotus pulcherrimus (HpBase: 말똥성게 게놈의 데이터베이스)
【저자명】 Sonoko Kinjo 1 , Masato Kiyomoto 2 , Takashi Yamamoto 3 , Kazuho Ikeo 1 , Shunsuke Yaguchi 4
<소속>
1국립유전학연구소 유전정보분석연구실(国立遺伝学研究所 遺伝情報分析研究室)
2오차노미즈여자대학 완간(연안)생물교육센터(お茶の水女子大学 湾岸生物教育研究センター)
3히로시마대학 대학원이학연구과( 広島大学 大学院理学研究科)
4 쓰쿠바대학 시모다임해실험센터(筑波大学 下田臨海実験センター)
【게재지】 Development Growth & Differentiation
DOI: 10.1111/dgd.12429

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